RNA skevensiodatan analyysi

Palvelun nimi

RNA-sekvensointidatan analyysi

Palveluntarjoaja(t)


Laskennallisen lääketieteen keskus, Turun biotiedekeskus, Turun yliopisto
https://elolab.utu.fi
mbc@utu.fi

Asiakas

RNA-sekvensointidatoja teettävät yksityiset tai akateemiset toimijat

Kesto

Data-analyysitulokset toimitetaan pääsääntöisesti kalenterikuukauden sisällä raakadatan toimituksesta.

Hinta

Kysy tarjous

Aloitus

Palvelu päästään aloittamaan noin viikon sisällä projektin sopimisesta, riippuen raakadatan toimitusaikataulusta.

Kuvaus

Illumina-laitteilla tuotetun ihmis-, hiiri- tai seeprakalanäytteistä peräisin olevan RNA-sekvensointidatan perusanalyysi sisältää seuraavat kohdat:

–       Aloituspalaveri

–       Aineiston laaduntarkistus

–       Sekvenssien linjaus referenssigenomiin ja geenitason signaalien kvantitointi

–       Geeniekspressioerojen testaus näyteryhmien välillä ja kandidaattigeenien poiminta

–       Funktionaalinen analyysi

–       Kattava raportti tehdyistä analyyseistä ja tulostiedostoista

–       Tulospalaveri